夏，为禹贡豫州之域。
商，为汤都，称北冡。
西周称漆邑。
公元前595年归楚，称楚北地漆园；秦，属砀郡；汉初，分西北境为梁国蒙县，东南境为沛郡山桑县。
三国时，属魏谯郡山桑县。
东晋侨置蒙县，仍属谯郡；南北朝时，属宋山桑县。
南齐仍为山桑县；北魏皇兴元年（467），废山桑县建置涡州，在漆园故城建置涡阳县；梁大通二年（528），梁改置涡州为西徐州，后置北新安郡；东魏武定八年（550），置南谯州，并山桑、蒙县为蒙郡。
北齐复称蒙县；隋开皇十六年（595），称淝水县；大业七年（611），改淝水县为山桑县；唐天宝元年（742），正式定名为蒙城县。
此后，虽归属屡有变更，但县名一直沿用未变；五代时，为河南道亳州蒙城县；宋代，先后属安丰军、亳州、寿州；元代，属总管府安丰路。
明代，属南直隶凤阳府；清代，先后属亳州、颍州；1912年，属安徽省寿州。
1914年6月，属安徽省淮四道。
1928年3月，直属安徽省。
1942年10月，属安徽省第六（泗县）行政督察区。
1938年6月，属安徽省第三（阜阳）行政督察区。
1944年12月，蒙城县北境归宿蒙县，属淮北路西第二行署。
1945年12月，宿蒙县属华中区第八行署。
1947年6月，宿蒙县属豫皖苏区第三行署。
11月，县南境归蒙城县，属豫皖苏区第六行署。
1949年3月，裁撤宿蒙、宿怀、蒙城（涡河南）、涡阳4个边区县，设蒙城县，原蒙城辖区恢复，属豫皖苏区第六行署。
4月12日，属皖北行署阜阳专区。
1952年4月12日，属安徽省阜阳专区。
1971年3月29日，属安徽省阜阳地区。
1996年，撤销阜阳地区和县级阜阳市，设立地级阜阳市，属安徽省阜阳市。
2000年6月，撤销县级亳州市，设立地级亳州市。
蒙城县划归亳州市管辖。