清康熙四十六年（1707年），石龙镇境域属节里九甲。
民国元年（1912年）初，设置石龙场公所。
民国十八年（1929年），称石龙里；民国十九年（1930年）6月，建石龙乡；民国二十四年（1935年）9月，石龙乡改为石龙联保；民国二十九年（1940年）8月，石龙联保改为石龙乡。
1952年12月，石龙乡划部分建长岭乡。
1956年1月，石龙乡长岭乡并入；同年11月，石龙乡析置长岭乡。
1958年9月，石龙、长岭乡合并建石龙公社。
1959年2月，石龙公社改为石龙管理区；同年8月，增设长岭管理区。
1960年12月，改石龙管理区改为石龙公社。
1966年初，石龙公社更名幸福公社。
1968年夏，复名石龙公社。
1982年，由石龙公社改为石龙乡。
1993年12月，石龙乡、长岭岗乡合并建石龙镇。
2001年5月，花石镇（除盐井村、天台村外）并入石龙镇。