明代，属云篆里。
清康熙四十六年（1707年），为孝里；清末，设鱼洞场。
民国元年（1912年）初，鱼洞场为乡级政区；民国十九年（1930年），始建鱼洞镇。
1951年12月，鱼洞镇析置大窝乡。
1952年3月，洞镇析置石板乡（小坝乡）；同年10月，鱼洞镇划归重庆市第四区。
1953年2月，划回巴县。
1954年1月，巴县人民政府迁驻鱼洞。
1974年，设立巴县鱼洞区。
1986年1月，撤销鱼洞区，设立区级鱼洞镇。
2001年7月，鱼洞镇、百节镇2镇合并设立鱼洞街道。