先秦时期，今文殊镇境域属西羌地。
秦代，为乌孙地。
西汉初年，为匈奴昆邪地。
元狩二年（公元前121年），霍去病率军击破匈奴右地，置酒泉郡，文殊境域属酒泉郡天（阝衣）县。
东汉，属酒泉郡延寿县。
十六国时期，先后属前凉、西凉、北凉政权管辖。
隋代，属福禄县。
唐代，属酒泉县。
北宋，属回鹘地，后属西夏。
元代，属肃州路。
明代，属肃州卫。
清雍正二年（1724年）后，属肃州酒泉县。
民国时期，属酒泉县西南乡。
1950年，西南乡改为西南区，辖10个乡，境内设文殊乡、河口乡。
文殊乡为西南区第九乡，乡政府驻崔家南庄子（今文殊村二组）；河口乡为西南区第十乡，乡政府驻闫家庄子（今河口村二组）。
1954年7月，增设塔湾乡，乡政府驻塔儿湾堡。
1955年，酒泉县撤区并乡，撤销西南区，文殊乡、河口乡并入塔湾乡，乡政府驻塔儿湾堡。
1958年，撤销乡建制，以原西洞乡和塔湾乡行政区域成立文殊人民公社，公社机关驻崔家南庄子（今文殊村七组）。
1961年4月，文殊人民公社分为塔湾、西洞2个人民公社。
后塔湾人民公社更名为文殊人民公社，公社机关驻塔儿湾堡（今文殊村七组）。
1966年9月，文殊人民公社更名为前进人民公社。
1971年，复名文殊人民公社。
同年11月，文殊人民公社划归嘉峪关市。
1983年，撤销文殊人民公社，成立文殊乡，乡政府驻塔儿湾堡。
2003年1月，撤销文殊乡，设立文殊镇。