东晋咸和六年（331）置宝安县，范围包括今深圳市、香港特别行政区、东莞市部分地区、广州番禺区南部、中山市等地区。
深圳地区自从唐朝中期起归入东莞县管辖，因距离较远，治理鞭长莫及，深圳、香港地区频受倭寇、海盗侵扰，尤其在明朝中期以后，兵祸不断，经南头乡绅的提议，在广东海道副使刘稳的支持与筹划下，明朝万历元年（1573），在宝安故地建“新安县”，取“革故鼎新，去危为安”之义，为东莞守御千户所城，即现南头古城。
清康熙五年（1666）裁新安县归并东莞县。
清康熙八年（1669）7月复置新安县，仍属广州府，辖治南头。
清道光二十二年（1842）、咸丰十年（1860）、光绪二十四年（1898），英国先后割占或租借新安县所辖香港岛、九龙司、新界共1066平方千米的土地（1997年7月回归中国）。
1914年，因与河南省新安县同名，改名宝安县。
1949年后，仍称宝安县。
1953年，县治由南头迁至深圳墟。
1979年，撤销宝安县设立深圳市，下设沙头角、龙岗、葵涌、龙华、罗湖、南头、松岗7个区。
1980年8月设深圳经济特区。
1982年国务院批准恢复宝安县建制。
辖深圳经济特区之外的原宝安县地区，属深圳市。
1992年11月再撤宝安县，分设宝安、龙岗2区，宝安区辖西乡、福永、沙井、松岗、公明、石岩、龙华、观澜8镇。
宝安区于1993年元旦挂牌办公。
2004年辖镇全部改为街道。
2007年5月31日，光明新区设立（为功能区）。
2024年9月19日，深圳市光明区揭牌成立，原属宝安的光明街道、公明街道、新湖街道、凤凰街道、玉塘街道、马田街道划归光明区管辖。
2024年10月27日，龙华新区成立，（为功能区），2024年9月，国务院批准设立深圳市龙华区，原属宝安的观湖街道、民治街道、龙华街道、大浪街道、福城街道、观澜街道划归龙华区管辖。