福田地域历来为宝安县（新安县）辖地。
东晋时宝安建县。
唐中叶，宝安县建制被撤销。
明万历元年（1573），属新安县归程乡六都；清属官富司。
1914年改新安县为宝安县，属宝安县；1924-1932年属第三区；1941年属第二区。
1949年属宝安县沙头乡；1950年属二区；1958年属沙头乡；同年年并入南天门公社；1959年并入附城公社；1978年分出设沙头公社；同年4月，改称福田公社。
1979年3月，撤销宝安县设立深圳市，同年4月成立罗湖区（市政府派出机关），辖福田、附城2个公社，1980年8月，深圳、沙头角、附城、福田、南头、蛇口、盐田公社被划为深圳经济特区。
1981年10月，市政府将深圳镇、南头、蛇口、盐田三个公社和沙头角镇划入，成立罗湖区人民政府（辖整个深圳市特区），1982年5月沙头角镇划出，1983年6月，根据深府[1983]118号文件精神，深圳特区内设置罗湖、上步、南头、沙头角4个区办事处，作为市政府派出的县级办事机构，其中上步区办事处管辖红岭路以西至车公庙以东区域，辖上步、福田两个办事处，同年11月，上步区设园岭、南园、福田、沙头、梅林5个街道。
1985年3月，上步区办事处改称为“深圳市人民政府上步管理区”，辖福田、南园、沙头、园岭、梅林5个街道，25个居委会，14个村委会，45个自然村。
1989年4月，上步管理区增设华富、香蜜湖2个街道。
1990年1月4日，经国务院批准，深圳市设立福田区、罗湖区和南山区（县级建制）。
其中福田区管辖园岭、南园、福田、沙头、梅林、华富和香蜜湖共7个街道。
区人民政府驻深南中路，原上步管理区相应撤销。
2002年，福田区将原有的116个居委会调整合并为85个社区居委会。
同年6月，福田区增设莲花街道。
2005年6月，福田区按照深圳市社区工作会议精神，顺利完成了社区居委会和社区工作站“居站分设”社区管理体制改革工作。
2007年，全面推行“一站多居”社区管理体制，实行“大工作站、小居委会”管理模式，全区社区居委会在原有92个的基础上增加22个，总数达114个。
全区社区工作站总数94个。
2009年7月，经市政府批准，从园岭、华富、福田、沙头4个街道调整分出华强北和福保2个街道，全区街道由之前的8个调整扩展至10个。
至2024年，福田区辖园岭、南园、福田、沙头、梅林、华富、香蜜湖、莲花、华强北和福保10个街道，92个社区居民委员会，名称沿用至今。