秦属桂林郡，汉到晋属郁林郡，唐属羁縻双城州，宋、元置泗城州，州治在今下甲镇。
洪武六年（1373），将州治迁至古磡峒（今凌云县城）。
清初仍称泗城州。
顺治十五年（1658），因泗城岑氏土官岑继禄有功于朝，叙功晋泗城土州为泗城土府。
顺治十八年（1661）又称为泗城军民府。
雍正五年（1727）改土归流，正式称为泗城府，隶属右江道。
乾隆五年（1740）置凌云县。
1912年废县设泗城府，次年废府复县。
1952年与乐业县并为凌乐县，1962年撤销，重置凌云县。