1941年建县时命名纳雍县，沿用至今。
秦属巴郡汉阳县。
汉属犍为郡平夷县，后属牂牁郡平夷县。
东晋属平蛮郡平蛮县。
唐时为汤望州和郝州。
宋先后属姚州、罗氏鬼国。
元为市北洞长官司地，属顺元路宣慰司亦奚不薛。
明先后属四川黔南道贵州宣慰司、四川川南道水西宣慰司（中水）、贵宁道水西宣慰司木胯则溪、火著则溪、化各则溪地。
清为大定府辖地。
1941年析大定县西北3区及水城、织金、郎岱部分地置县，属贵州省第四行政督察区。
1949年属毕节专区。
1970年属毕节地区。
2024年属毕节市。