元至元二十年（1283），四川行省讨平九溪十八洞后置顺元等路军民安抚司，辖贵州等处二十四长官司，其中置于县地的有落邦扎佐等处和六广等处蛮夷长官司，隶四川行省。
至元二十九年（1292）改隶湖广行省。
明洪武五年（1372），县地蛮夷长官司长官内附，改置为扎佐长官司，复隶四川行省；同时，裁六广等处蛮夷长官司，将其地归入贵州宣慰使霭翠亲领水西地，水西则纳入于的则溪属的龙尔（今龙场）、底飞（今六广）二目。
永乐十一年（1413）置贵州行省，县境各长官司即属贵州节制。
正德三年（1508年），被贬谪为龙场驿丞的兵部主事王阳明抵达龙场，并在此潜心研究《易经》，反思程朱理学，大悟“格物致知”之旨，创立“知行合一”学说，晚年又阐发了“致良知”的学术宗旨，创立了“心学”体系。
开启教育先河，影响日渐深远，修文也因此被誉为“心学圣地”。
崇祯三年（1630）置敷勇卫，设修文守御千户所。
“修文”始作为地名。
康熙二十六年（1687）建县，取“偃息武备，昌明文教”之意，命县名为修文，隶贵阳府。
1912县属黔中道，1914年8月，划修文县北部仁和里全境、信顺里5个甲和崇义里3个甲，以及贵阳、紫江（今开阳）部分地置息烽县。
1916年，由息烽、修文和贵阳等县知事实地踏勘划定县界。
至此，民国修文县界基本固定。
1949年解放后，县隶属贵阳专区。
1952年11月，贵阳专区改称贵定专区。
1956年4月，改属安顺专区。
1958年12月，改属贵阳市。
1963年10月，复改属安顺专区。
1996年1月，正式归属贵阳市辖。