民国二十四年（1935年），置县时设牙叉乡，属白沙一区。
民国三十四年（1945年）6月，与白沙乡合并为牙白乡。
民国三十五年（1946年），复析牙叉、白沙2乡。
民国三十七年（1948年）冬，始为白沙县人民政府驻地。
1949年，析设牙叉、珠江、牙炳、九架4个乡。
1958年上半年，组建县治镇，牙叉、九架、牙炳、珠江等乡并入。
1958年，并入白沙公社。
1959年初，析出建立牙叉公社。
1959年上半年将细水片析出成立细水公社。
1959年下半年复并入牙叉公社。
1961年6月，复析出细水公社，牙叉公社按原名。
1983年，改为牙叉区。
1987年，改为牙叉镇。
2002年7月，白沙镇和南叉乡并入。