黄流，黄帝后裔的流落之地。
明代之前，黄流镇一直属于崖州（今三亚）的建制之内。
[11-12]唐代武德五年（622年）迁移来琼建村。
五代十国，承袭唐制。
宋代崇宁五年（1106年），在珠崖军黄流白沙侧浪之间置延德县。
大观元年（1107年），改延德县为延德军。
政和元年（1111年），废通远县为通远镇，隶属珠崖军。
元代基本沿袭宋制。
明代建黄流村。
明代万历四十四年（1616年），崖州瑞芝山建造“乐安城”，其中的代表就是古镇黄流。
清康熙二十八年（1689年），在抱由峒设乐安营。
民国九年（1920年），民国政府将崖州改为崖县。
民国二十八年（1939年）8月，日军占领昌感地区后，辖黄流、保平、海头、北黎本部四个派遣队。
1950年5月，成立崖县人民政府。
1954年1月1日，崖县划归海南黎族苗族自治区领导。
1958年10月前，属崖县洪流公社管辖；同年10月初，前属崖县洪流公社管辖，当月下旬划归乐东黎族自治县管辖，所在洪流公社名称不变。
1959年，撤销洪流公社后，成立了黄流公社。
1983年，改为黄流区公所。
1987年1月，改为黄流镇。