依兰县是省级历史文化名城，人文历史源远流长。
早在五千年前的原始社会新石器时期，依兰的先民就在此繁衍生息。
从先秦时开始，依兰始终处于肃慎、挹娄、勿吉、靺鞨、女真族的中心区域。
自唐代勃海国时建置，设铁利府；辽为生女真五国部越里吉国（五国头城）、金设胡里改路；元设胡里改、斡朵里万户府；明设忽儿海（今依兰旧古城）、斡朵里、呕汗河等卫；清设三姓副都统衙门，管辖北至外兴安岭，东至库页岛的广大区域；清末设东北路道后改称依兰道，管辖松花江下游十二县。
1905年在三姓城设依兰府，1912年改为依兰县。
1945年抗战胜利后，初辖于合江省，后隶属于松江省。
1954年松江省与黑龙江省合并，成立黑龙江省，依兰县隶属黑龙江省。
1991年4月1日，划归哈尔滨市管辖。