崇川最早称胡豆洲。
唐玄宗开元十年（722），胡逗洲设盐亭场，置盐官，属扬州海陵监，隶淮南道。
唐僖宗乾符二年（875），设狼山镇。
唐末时设东洲静海军，后改设为静海都镇。
南唐设静海制置院。
后周显德五年（958）正月，周占领后，改为静海军；三月，升静海军为通州，下设静海、海门两属县。
今境域属静海县。
宋政和七年（1117），通州改为静海郡，不久又恢复为通州。
北宋天圣元年（1023），因避讳，通州改称崇州。
元世祖至元十五年（1278），置通州路，设总管府。
至元二十一年，复称通州。
明洪武元年（1368），仍置通州，属扬州府，领静海、海门两县，境域属静海县。
清顺治二年（1645），通州改为直隶州。
1912年，废通州，设南通县。
1958年9月，城区部分的9个街道分别改为5个人民公社。
1979年4月，撤销了4个人民公社，改设城中区。
1983年8月，改名为城区。
1991年6月，更名为崇川区，名称沿用至今。