春秋战国时期，先后属吴、越、楚，因位于吴故都娄门之东，名娄邑。
秦置疁（liú）县，属会稽郡。
王莽始建国年间，更为娄治。
东汉时期称娄县。
以后历经汉、三国两晋、南北朝的宋齐时，沿袭不变。
梁天临六年（507），分娄县置信义县，属信义郡。
梁大同二年（536），分信义县置昆山县。
隋开皇九年（589），撤昆山县并入吴县；十八年（598），复置昆山县，属苏州。
唐天宝十年（751），析昆山南境、嘉兴、海盐的东北境置华亭县，昆山县治移至马鞍山南今址。
宋嘉定十年（1217），析昆山东南境5乡置嘉定县。
元贞元年（1295），升昆山县为昆山州，仍属平江路。
明洪武二年（1369），降昆山州为县，属苏州府。
明弘治十年（1497），析昆山、常熟、嘉定三县部分地域置太仓州。
清雍正二年（1724），分昆山县置新阳县，两县同城分治，同属苏州府。
1912年，昆山、新阳两县合并，名昆山县，属江苏省上海道。
1914年，属苏常道。
1934年，属无锡行政督察区。
1949年5月，属苏州专署；7月，建立昆山县人民政府。
1968年3月，属苏州专区。
1971年4月，属苏州地区。
1983年3月，属苏州市。
1989年9月，昆山撤县设市。