春秋时期属吴国，战国时期先属越后属楚。
秦代属东海郡，汉武帝元狩六年（117）置淮浦县，属临淮郡。
南齐建元二年（480），以东海郡属于冀州，称北海郡，侨治涟口（即今涟城）并于北境置襄贲县。
隋开皇五年（585），改襄贲为涟水。
唐武德四年（621），置涟州，在县境北30公里分置金城县。
北宋太平兴国三年（978），置涟水军，属淮南东路。
北宋熙宁五年（1072），军废，仍为涟水县，隶属淮南东路楚州。
南宋三年（1262），改为安东洲。
元至元十二年（1275），安东洲归附元，改为涟州。
旋复称安东洲。
明洪武二年（1369），降为安东县，属淮安府。
清因之。
1914年，因与奉天省安东同名，复称涟水。
先直属省，后属淮扬道。
1927年废道，涟水隶属省。
1933年，全省改为9个区，涟水属于第八区（东海区）。
1941年元月，以盐河为界，划河东为涟东县，属盐阜区，河西为涟水县，属淮海区。
中华人民共和国成立后，涟水两县于1950年6月合并仍称为涟水县，属淮阴专区。
1970年，淮阴专区改为淮阴地区，涟水属于淮阴地区。
1983年江苏实行市管县，涟水属于淮阴市。