五代初称静海镇。
后周显德五年（958）建通州，领静海、海门两县，属扬州；宋天圣元年（1023）改通州为崇州，又名崇川，后仍称通州；政和七年（1117）改为静海郡，不久复名通州；元至元十五年（1278）升为通州路，不久仍称通州；清雍正二年（1724），升通州为直隶州，为区别于直隶省的通州，俗称南通州；1912年5月，废州改称南通县；1993年2月，撤销南通县改设通州市；2009年3月，经国务院批准，根据《江苏省政府关于撤销通州市设立南通市通州区的通知》（苏政发〔2009〕60号），撤销通州市，设立南通市通州区。