秦始皇帝二十六年（前221)，设新淦县，县治淦阳镇，隶属九江郡，新始建国元年（9）新淦县更名为偶亭县，隶属豫章郡。
东汉建武元年（25）偶亭县复名新淦县；永元八年（96）析新淦县、庐陵县地设石阳县。
三国时末帝宝鼎二年（67）析新淦县、石阳县地设巴邱县。
隋开皇十年（590）石阳、巴邱并入新淦县，隶属吉州。
南唐开元二年（938）新淦县析崇学，高安县建安、修高合设清江县。
元贞元年（1295），新淦县升为新淦洲。
明洪武二年（1369），新淦洲复名新淦县；明嘉靖五年（1526），新淦县析断金、扬名及善政、太平、上安国的部分地，共28部设置峡江县。
1914年属庐陵道；1931年属南昌区；1932年属第二行政区；1942年，属第一行政区。
1949年6月20日，新淦县人民政府成立，属南昌区。
1952年4月属吉安区。
1955年属吉安专区。
1957年5月，新淦县更名新干县。
1968年2月份属井冈山专区，1979年7月属吉安地区，2000年8月属地级吉安市。
沿用至今。