1983年10月10日，始建元宝山区，人民政府驻地元宝山公社。
1984年4月29日，开始乡镇街建制，辖8乡2镇5街道，即按原行政区域建哈拉卜吐、小五家、美丽河、山前、五家乡，以及合并的八家、公格营子、兴隆坡乡，平庄公社改建为平庄镇，建昌营公社改为建昌营镇，其行政区域不变，5个街道为元宝山、东电、西露天、马林和风水沟街道。
1986年，东电街道办事处更名为云杉路街道办事处，撤销五家乡，改建为五家镇。
1987年6月，八家乡与元宝山街道办事处合并，建元宝山镇；兴隆坡乡与风水沟街道办事处合并，建风水沟镇；同年7月，撤销小五家乡设小五家回族乡。
1988年7月，撤美丽河乡建美丽河镇。
1994年8月，撤销山前、公格营子乡建山前、古山镇。
1998年12月，哈拉卜吐乡和马林街道办事处合并组建马林镇。
2002年11月，平庄镇调整出19个居民委员会和平庄村成立平庄城区街道办事处。
2005年9月，喀喇沁旗马蹄营子乡划入元宝山区。
2006年9月，11个乡镇合并调整为风水沟、元宝山、美丽河、平庄、五家5个镇，平庄城区、西露天2个街道办事处。
2010年2月，对元宝山、平庄镇和平庄城区街道办事处进行区划调整，增设云杉路、马林、平庄东城、平庄西城4个街道办事处。
2024年1月，经自治区人民政府批准复置小五家乡。