夏时，属青州。
商时，为莱国地。
周时，境域有襸、密、邶殿、都昌和棠乡。
秦时，置都昌县，属胶东郡。
汉时，增平城、胶阳、下密。
唐初，置訾亭、华池、胶东、平城和下密5县，不久皆撤销，归入北海县。
宋建隆三年（962），由青州北海县析唐安乡置昌邑县；乾德三年（965），改属潍州。
元时，属山东东西道宣慰司益都路总管府潍州。
明初，属青州府，洪武十年（1377年），撤销昌邑归潍县；二十二年（1389年），恢复昌邑县，改属莱州府平度州，在北部滨海设渔儿镇（今渔尔堡）巡检司。
清初，属莱州府平度州，雍正十二年（1734），改属莱州府。
1913年属胶东道。
1925年属胶莱道。
1928年直属山东省。
1938年属第八行政督察区。
1939年后，属第十三行政督察区。
1945年，改属第十七行政督察区。
1941年，抗日民主政权昌邑县人民政府在瓦城成立，辖县境北部地区，属胶东区西海专区；1942年7月，改属清河区清东专区；1944年，属渤海区第五专区。
1944年5月，与潍北县合并称昌潍县，属渤海区第五专区。
1945年6月，复分，改属胶东区西海专区。
1945年8月，原昌邑第十区即宋庄及其以南地区划入平度和高密，随后又分置，初为昌南行署，10月改建昌南县，属西海专区。
1948年秋，政府机构由马渠移驻县城。
1950年5月，昌邑、昌南2县改属昌潍专区（昌潍地区、潍坊地区、潍坊市）。
1956年4月，昌南县并入昌邑县。
1994年6月，撤销昌邑县，改设县级昌邑市。