1992年设立东港区，东港区所辖范围,原为日照县境域。
东港地域历史悠久。
周时,为莒地。
秦时,属琅琊郡。
西汉时,置海曲县。
东汉时,置西海县。
三国魏时,属青州城阳郡。
西晋时,复入莒县。
北魏时,置梁乡县。
隋时,归莒县,属琅琊郡。
唐、宋时,属密州。
北宋元祐二年(1087),置日照镇,属莒县,日照之名始于此。
金大定二十四年(1184),始设日照县,属益都府莒州。
元、明时,沿袭。
清时,属沂州府。
1913年,撤府,属胶东道。
1928年,撤道,直属省政府。
1940年3月,日照县抗日民主政府成立,先后属滨海专区、滨海区滨中行政区。
1950年,属沂水专区。
1956年,归临沂专区。
1985年3月,经国务院批准,撤日照县设日照市(县级),仍属临沂地区。
1989年6月,升级为地级市。
1992年12月,将原日照市所辖区域设为东港区,东港区自此正式成为政区名称。
1993年5月,将所辖的岚山、碑廓、汾水、虎山四镇(街道)划出,设为日照市岚山办事处。
2004年9月,撤岚山办事处设岚山区;10月,将东港区的后村、高兴、巨峰、黄墩四镇划归岚山区。
2024年,后村镇归东港区。