春秋时为齐国柯邑。
秦置东阿县。
西汉东阿县仍属东郡，为都尉治所。
东汉因之。
西晋末县废，北魏复置东阿县，属济北郡。
隋开皇十六年(596)析东阿县西境置阳谷县，属济州。
唐初阳谷县仍属济州，天宝十三年(754)阳谷县改属郓州。
北宋景德三年(1006)阳谷县徙治于孟店(今阳谷镇)，北宋末属东平府。
元属东平路。
明阳谷县属兖州府东平州。
清初仍属兖州府。
1913年属济西道(1914年改称东临道)。
1925年属东昌道。
1937年1月属山东省第六行政督察区。
1939年9月始建抗日民主政府，属鲁西北行政委员会。
1940年4月属鲁西行政区运东专区。
1941年初，寿张、阳谷、东阿、东平4县毗连地带置张秋县，阳谷县东部的张秋、阿城、十五里园等地划入张秋县。
同年7月冀鲁豫和鲁西2行政区合并为新的冀鲁豫行政区，阳谷属该行政区第四专区。
1943年初，泰西、运东两专区合并为泰运专区，阳谷县属晋冀鲁豫边区第十六(泰运)专区。
1944年5月阳谷属冀鲁豫行政区第一(泰运)专区。
1946年11月属冀鲁豫第六(运东)专区。
1947年9月改属第九专署。
1949年9月改属平原省聊城专署。
1952年12月平原省撤销，改属山东省聊城专区。
1958年12月阳谷县建制撤销，并入寿张县。
1961年7月恢复阳谷县建制，仍属聊城专区。
1967年专区改称地区，阳谷县改属聊城地区。
1997年8月聊城地区改为地级聊城市，阳谷县改属聊城市。