唐、虞、夏、商境属冀州地；春秋属晋；战国属魏；秦属河东郡皮氏县；西汉属司隶部河东郡，汾南为左邑县（今闻喜）。
汾北部分属长修县（今新绛）。
汾南为稷山亭，县西北境为冀亭；东汉废左邑、长修二县，汾北划入皮氏县（今河津），汾南部分归闻喜县。
今县城处为冀亭，汾南为稷山亭；三国属魏司州，汾北为平阳郡皮氏县，汾南为河东郡闻喜县；西晋属司州，汾北仍为平阳郡皮氏县，汾南仍属河东郡闻喜县；前赵、前秦、后秦均属平阳郡；北魏属东雍州正平郡。
北魏太和十一年（487），析闻喜、龙门两县部分区域为高凉县（县治在今县城东南15公里处），并置高凉郡，郡治在高凉，辖高凉、龙门（今河津）两县。
此为今稷山独立设县始；东魏、西魏、北齐、北周时，汾北属东魏、北齐，仍称高凉县；汾南属西魏、北周，西魏筑城于玉壁（今县城南6公里处白家庄村北），北周将玉壁置为勋州，勋州撤销后，移绛州治于此；隋开皇十八年（598），绛州治由玉壁移至正平（今新绛），变为绛郡，并改高凉县为稷山县，且筑城于汾河之北（今县城），邑属绛郡；唐时，稷山属河东道绛州；五代初属后梁河中府；后唐同光三年（925）属绛州；北宋属河东路绛州；元初属晋宁路绛州。
元大德九年（1305）改属平阳路，后归晋宁路绛州；明属平阳府绛州；清仍属绛州；1914年，邑属河东道；1932年属山西省第七行政专员公署，1938年改属第八行政专员公署，1942年复归第七行政专员公署；1947年4月稷山解放，8月，县境汾北地区仍称稷山县，属晋绥十专署辖。
汾南则与河津县汾河以南地区组成稷河县，县治在今稷山翟店镇，属太岳三专署辖；1948年8月，稷河县撤销，稷山县恢复原建制，仍属晋绥第十专署辖，次年改属晋南行政督察专员公署；1951年3月，归运城专员公署辖；1954年，运城、临汾两地区合并为晋南专署，属晋南专署；1970年，晋南专署分为临汾、运城两专署（后改为行政公署），县属运城行政公署；2000年4月，运城地区撤地建市，稷山属运城市；区划不变至今。