屏山县在汉、晋时先后属键为郡、越崇郡。
唐代属戎州都督府。
宋属叙州，通称马湖部。
元至元十三年（1276年）置马湖路总管府，治所涪口，即今新市镇。
元大德四年（1300年）迁至屏山镇，下辖6个长官司。
明洪武四年（1371年）改为马湖府。
明万历十七年（1589年）置屏山县，隶属马湖府，府县同城。
清雍正五年（1727年）撤马湖府，屏山县属叙州府。
民国元年以后，属永宁道。
1935年属四川省第五行政督察区，后为乐山专区。
1956年后改属宜宾地区。
2003年12月24日，将宜宾县真溪乡和高场镇的蒋坝、石盘2个村成建制划归屏山县管辖，乡政府驻新农；真溪乡更名为新发乡。
2006年3月24日屏山县政府驻地由屏山镇迁至新发乡。
2006年3月28日，屏山县调整乡镇行政区划为16个乡镇。
具体为：撤销清凉、龙桥、大桥、安全、冒水5个乡，分别并入屏山镇、新安镇、新市镇、中都镇、清平彝族乡，各镇乡政府驻地分别是共和村、新江村、龙口村、中都场、冒水村，屏山镇更名为锦屏镇。
2010年12月16日，撤销福延镇、楼东乡，设立书楼镇，镇人民政府驻书楼村。
至此，屏山县辖8镇7乡。
2024年，撤销新发乡，设立屏山镇，为屏山县县城所在地。
2024年8月，龙溪乡并入龙华镇；太平乡并入中都镇；富荣镇并入锦屏镇；鸭池乡和大乘镇三合村、马脑村并入屏山镇；调整后，辖8镇3乡（其中2个彝族乡）。