小王庄镇建国前，属河北省静海县，1949年属该县七区。
1953年以小王庄地区设小王庄和西湾河2个乡，1958年属团泊洼公社大庄子管理区。
1962年小王庄地区8个村（时称八村）划归静海农场（现称北大港农场），1963年划属天津市北大港区。
1965年命名为小王庄公社，1970年并入南郊区，1979年归大港区。
1983年改社建乡，1986年撤乡建镇。
现在的小王庄镇是2001年行政区划调整，由原大港区小王庄镇和徐庄子乡合并而成，2009年11月12日塘沽、汉沽、大港行政区划调整，成立滨海新区，2010年1月根据滨海新区政府（津滨政发【2010】3号）文件将其更名为天津市滨海新区小王庄镇人民政府。