乾隆二十八年（1763）为科布多参赞大臣所辖；同治十年（1871）在克兰河边修建承化寺。
光绪三十一年（1905）科（科布多、阿（阿尔泰）分治后，是阿尔泰办事大臣辖境及驻地。
1912年，阿尔泰办事大臣改为办事长官，为其辖境及驻地。
1913年，设承化县佐。
1921年置承化县，隶属阿山道。
后属阿山行政区。
1950年，属阿山专区。
1953年，更名为阿泰县，隶属阿勒泰专区。
1954年，更名阿勒泰县，隶属阿勒泰专区。
1958年，成立红墩、向阳、克木齐、盐池、卫东、切尔克齐、康布铁堡公社。
1970年、属阿勒泰地区。
1984年，阿勒泰撤县建市。
截止2024年底共有4个街道办事处，24个社区居民委员会。
分别为金山路办事处的金山路、金山北路、文化路、八道巷、园林5个社区居民委员会；解放路办事处的解放路、解放北路、解放南路、览景4个社区居民委员会；团结路办事处的团结路、团结南路、银水路、滨河路4个社区居民委员会。
恰秀路办事处的恰秀、雪都、克兰、额河、红石、红墩路6个社区居民委员会；北屯镇的团结、恩泽、阿山、额河、胡杨5个社区居委会。
5镇6乡102个村民委员会，分别是阿拉哈克镇、红墩镇、阿苇滩镇、切木尔切克镇、北屯镇、喀拉希利克乡、萨尔胡松乡、巴里巴盖、切尔克齐乡、汗德尕特蒙古族乡、拉斯特乡。