清乾隆二十四年（1759）在精河东岸筑城取名“安阜”设典史。
二十六年（1761）安阜城增设都司，管理军事。
三十六年（1771）吐尔扈特部东归，一部分安置于此。
光绪十四年（1888）设精河直隶抚民厅，隶伊塔道。
1913年直隶厅改设精河县，隶属伊塔道。
1929年隶属伊犁行政区。
1950年属伊犁专区，全县下设3区、11乡。
1954年7月，博尔塔拉蒙古自治区成立，精河县隶博尔塔拉蒙古自治区。
1955年2月，博尔塔拉蒙古自治区改称博尔塔拉蒙古自治州，隶属不变。