第十三师前身是中国人民解放军第一野战军第一兵团第六军第十六师，1953年6月整编为中国人民解放军新疆军区农业建设第五师，1957年1月编为红星总场，1959年1月恢复农五师建制，1963年2月师部西迁博乐，在哈密设农五师哈密管理处，1975年3月改称哈密地区农垦局，1982年4月恢复为新疆生产建设兵团哈密管理局，2001年1月，更名为新疆生产建设兵团农业建设第十三师，2024年12月更名为新疆生产建设兵团第十三师，2024年1月12日国务院同意设立县级新星市，沿用至今。