7世纪前，噶尔地方隶属象雄阿尔巴。
7世纪中叶，象雄被吐蕃征服，收为其领域，将噶尔地方划入象雄赤迪。
9世纪中叶，吐蕃崩溃，噶尔地方被没卢氏占据。
10世纪中叶，噶尔地方归属古格王朝。
13世纪初，噶尔地方归服蒙古汗，隶属纳里速古鲁孙元帅府。
14世纪中叶，噶尔地方隶属明朝俄力思军民元帅府。
清康熙二十年（1681，藏历第十一饶迥铁鸡年），噶丹次旺率领讨伐拉达克的部队屯扎于此。
清康熙二十二年（1683，藏历第十一饶迥水猪年），噶丹次旺率部驱逐拉达克后，阿里地区正式归属西藏地方政府管辖，在噶尔藏布河南岸的噶尔昆莎，始设堆里噶本，在其境内设左左本和南木如本。
清道光二十年（1840，藏历第十四饶迥铁鼠年），克什米尔地区的查谟道格拉（即森巴）王室，为了垄断西藏地区与其藩属拉达克的羊毛贸易，吞并了拉达克，发动了侵藏战争，进犯阿里，强占噶尔亚莎（噶大克），西藏地方政府派遣藏军与当地军民一道抗击，全歼入侵敌军，收复了失地。
清光绪三十年（1904，藏历第十五饶迥木龙年），英军入侵西藏，曾在噶尔亚莎开辟市场，开办商埠。
1951年，噶大克宗和平解放，隶属堆里噶本。
1954年，噶大克宗隶属阿里总管。
1955年，噶大克宗更名为噶尔宗。
1959年4月，阿里地区军事管制委员会成立，噶尔宗隶属阿里地区军事管制委员会管辖。
1960年1月，经国务院批准，撤销噶尔宗，设立噶尔县，隶属阿里专区。
1970年11月，阿里专区更名为阿里地区，噶尔县属之。