唐、宋时期属于弱水西悉董王辖区。
元朝属于朵甘思宣慰使司都元帅府，由芒康台吉管辖。
明代后期归昌都强巴林寺管辖。
崇祯十五年（1642），噶丹颇章政权建立后，在桑昂曲宗地方设立桑昂曲宗（今林芝地区察隅县）和作岗宗（今左贡县），由噶丹颇章政权直接管理。
清雍正三年（1725），左贡地方复归芒康台吉管理。
宣统二年（1910），作岗宗改为科麦县，隶属昌都府。
1911年，实施改土归流。
1918年，西藏地方政府将科麦县改为左贡宗，归朵麦基巧管理。
1939年，成立西康省，将科麦县（左贡）划入西康省。
1943年，西藏地方政府推行宗溪制，仍设左贡宗。
1950年，左贡辖有帮达宗、碧土宗、左贡宗3个宗，统称左贡宗。
1950年10月，中国人民解放军解放左贡宗，成立碧土解放委员会，后改为左贡宗解放委员会。
1960年1月，经国务院正式批准，撤销左贡宗，设立左贡县，隶属昌都专区。
2024年，撤销昌都地区，设立地级昌都市，左贡县隶属昌都市。