西汉武帝元封二年（前109），现盘龙区地域属谷昌县的一部份。
三国蜀汉及西晋属建宁郡。
东晋属晋宁郡。
隋、唐属昆州。
广德二年（764），南诏置拓东城，南诏应道元年（809）定鄯阐为东京，建极元年（860）改为上都。
宋大理时仍为善阐府，称东京。
蒙古宪宗四年（1254）立昆明千户。
五年立善阐万户府。
元至元十二年（1275）改称善州，下设昆明县。
十三年（1276）置云南诸路行中书省，改为中庆路。
洪武十五年（1382）改中庆路为云南府，沿称昆明县，现盘龙区辖区为元、明、清、民国年间省会衙署、官邸驻地。
1953年昆明县、市合并称市，设十个区，城区有一、二、三、四区，1956年将一、三区合并置盘龙区，设盘龙区人民委员会，1968年改为盘龙区革命委员会，1980年改为盘龙区人民政府，沿用至今。