西汉时为牂牁郡进桑县地，东汉时为牂牁郡进乘县地，蜀汉时为兴古郡进乘县地。
南北朝归建宁州梁水郡。
唐南诏时为通海都督辖地。
宋大理国时属秀山郡，分属褒古、屈中、阿马、阿月等部。
元初属阿僰万户舍资千户。
明代属临安府，分属王弄山长官司和南安长官司。
清初，清政府对开化府地区实行改土归流，属开化府所辖的新现安南、永平、王弄里之各一部地。
1913年设立靖边行政委员会，隶属蒙自开广道辖。
1932年国民政府对全国县市名统一规范，因“靖边”二字与陕西省靖边县雷同，同年11月25日云南省国民政府318次会议决定，以屏边境内的屏山（今大黑山）的“屏”字，原靖边县的“边”字，定名为屏边县，意为边疆屏障。
1949年12月至1950年4月，隶属滇南行署辖。
1950年4月后属蒙自专员公署辖，1957年11月18日暑红河哈尼族彝族自治州辖地至今。
1963年7月1日经国务院批准成立屏边苗族自治县，一直沿用至今。