“鹿城”之名始于东晋。
清乾隆《温州府志》卷五：东晋郭璞筑永嘉城于瓯江南，“因跨山为城，名斗城。
时有白鹿衔花之瑞，故又名鹿城。”亦称“白鹿城”。
唐上元二年（675）置温州后，属永嘉县。
1949年析永嘉城区及城郊、梧埏、永强、三溪、藤桥、西岸等区，设立温州市，此为鹿城区之前身。
1968年分别成立温州地区革命委员会和温州市革命委员会。
1980年温州市恢复省辖市，同年将市区分设为东城、南城、西城３个区。
1981年温州市与温州地区合并，原温州市成为温州的中心区，称温州市区。
1983年并东城、南城、西城３个区置城区。
1984年，新桥、南郊、黎明、城郊、双屿、仰义６个乡并入，并改名为鹿城区。
1992年新桥镇、景山街道划归瓯海县。
2001年瓯海区藤桥等５个乡（镇）及梧埏镇部分区域、永嘉县七都镇及桥下镇部分区域并入，形成现今之政区范围。